南明政权
一、绍武政权
清顺治三年(1646)十一月，朱聿钅粤在广州称帝，年号“绍武”，史称“绍武”政权。
绍武政权只存在了40天。清军平定福建后，分兵三路向西南进攻，东路由佟养界和李成栋率领攻打广东。清朝大军一到，潮、惠守将不战而下，广州孤立无援失陷。
绍武帝朱聿钅粤被捕后，清将让人送饭给他，他悲愤地说：“我若饮汝一勺水，何以见先帝于地下？”遂绝食自缢而死。同时身亡的还有周、益、辽等24王，东阁大学士苏观生也自缢而死，死前大书16字于墙壁： “生既无城，死亦万古。节报高皇，恩怜老母！”
大臣霍子衡合家在羊城，城破后他对家人说：“临难勿苟免，你们知道吗！”接着大书“忠孝节烈之家”六字于中堂，朝服北拜，然后投井而死。其妾、长子夫妻、长女、次子、三子夫妻及一小婢，也相继投井自尽。不少大臣闻讯，跟着纷纷自尽。事后广州人悄悄将他们的遗体合葬于流花桥附近，直至光绪九年，方为之树碑，称“绍武君臣冢”。
二、永历政权
1646年（明崇祯十九年）十一月，明广西巡抚瞿式耜、两广总督丁魁楚、湖广总督何腾蛟等拥立桂王朱由榔在广东肇庆即皇帝位，改元永历。
1647年正月，清军攻下肇庆，桂王先后逃到梧州、桂林、全州、武冈等地。1647年十一月，郝摇旗等部农民军在全州大败清军，“斩级无数”清军被迫退保湘南。
1648年，原来占据江西的降清明将金声桓和占据广东的降清明将李成栋，由于没有达到个人目的，对清廷不满。在人民坚持抗清斗争的影响下，他们先后反正。大顺军与明军乘胜大举反攻，连克靖州、常德、衡州、湘潭、衡山等地，包围长沙，几乎收复了湖广地区的全部失地。
但是，桂王政权不能利用抗清斗争的有利形势，反而引起了内部的斗争。对立集团双方互相攻击，各图私利，他们还排挤大顺农民军，这就削弱了抗清的力量。1649年春，清军攻破南昌，金声桓败死。不久，李成栋在渡水时溺死。同时，何腾蛟也在湘潭被俘，不屈牺牲。1650年十一月，清平南王尚可喜破广州；定南王孔有德破桂林，瞿式耜被执殉难。这时，大顺军的战斗力也大受损伤。余部由李来亨、贺锦率领，由贵州向巴东进发，继续坚持抗清斗争。
在张献忠牺牲后，遗部由孙可望、李定国、刘文秀、艾能奇等率领，在川南、云、贵一带，坚持斗争。当桂王走投无路时，只得接受了大西军的建议。1652年二月，孙可望迎桂王居于贵州的安隆所。
1652年（明崇祯二十五年）三月，大西军发动了大规模的反攻。李定国进入湖广后，连克重镇，再转攻广西，破桂林，清定南王孔有德兵败自杀。李定国又回师北上，直取长沙。十一月，李定国与清军主力大战于衡州城下，大破清军，击毙敬谨亲王尼堪，取得了辉煌的胜利。刘文秀在四川也大败清军，收复重庆等地，迫使吴三桂退守汉中。
但是，李定国在抗清斗争中的巨大战功，却引起了孙可望的忌妒。孙可望为了树立自己的威望，破坏原定的作战部署。李定国只得退回广西，转攻广东，后又转移到云南。孙可望于1657年以十余万大军进攻李定国。但广大将士临阵倒戈，投向李定国。孙可望日暮途穷，可耻的投降了清军。
1658年正月，清军攻陷昆明，桂王逃入缅甸。李定国退至孟艮（云南边境），继续坚持抗清斗争。
1662年（明崇祯三十五年，满清。康熙元年）春，吴三桂由缅甸俘桂王还昆明。后以弓弦绞杀于市，至此屹立东方文明长达306年的明朝统治正式结束。同年七月，李定国在勐腊（西双版纳自治州勐腊县）不幸病逝。
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